Nel semiarco del coro absidale, dietro il pilastro principale della Cripta, si aprono due finestre, che nella parte alta si incuneano al di là della volta, quasi a voler comunque emergere in cerca di un raggio di sole, perduto sul finire dei secoli bui, quando i Normanni pretesero una reggia castello al suo fianco, e spensero  la splendida gemma a navetta, che puntiforme splendeva dalla spianata del colle sulla paludosa lama di San Vito e Camaggio.

Queste due finestre absidali presentano un arco nella parte superiore, e appaiono affogate nella volta riedificata più bassa, allorché i lavori per la cattedrale superiore imposero ristrutturazioni e consolidamenti della chiesetta.

Si sdoppiano, inoltre in due aperture, quella più bassa strombata, quella in alto regolare con arco a tutto sesto.