I muri che risalgono alle finestre e agli archi presentano conci di diverso colore in più strati:
su un primo strato di base più caldo, si innestano le volte con conci più chiari;
le vele e le crociere sono infine completate, nuovamente, con conci più scuri.

Se non fosse che troppi elementi architettonici danno il senso di una utilizzazione di quanto era immediatamente a portata di mano (vecchi reperti e conci del pendio), senza eccessiva scelta dei materiali, nonché la probabile ricostruzione di parti della cripta nei secoli, sarebbe affascinante immaginarsi una volontà di ombrare le volte, di minimizzare la loro presenza, pur anche innestandole su colonne minimali ed essenziali nel decoro, perché ogni attenzione fosse rivolta all'Unica importante realtà del luogo: l'altare del Cristo Pantocratore.